Informacje o organizacji zajęć
Mikrobiologia z parazytologią i Immunologia
przedmiot realizowany przez Katedrę Mikrobiologii UJCM i Katedrę Immunologii UJCM
Koordynatorzy przedmiotu: prof. dr hab. Małgorzata Bulanda, prof. dr hab. Janusz Marcinkiewicz
Koordynatorzy zajęć w poszczególnych jednostkach:
Koordynator zajęć z mikrobiologii z parazytologią – prof. dr hab. Małgorzata Bulanda, Katedra Mikrobiologii UJ CM
Koordynator zajęć z immunologii – prof. dr hab. Janusz Marcinkiewicz, Katedra Immunologii UJ CM
Osoba do kontaktu z Katedry Mikrobiologii UJ CM
dr Agata Pietrzyk
telefon: 12 633 08 77 w. 224, e-mail: a.pietrzyk@uj.edu.pl
Forma zajęć z mikrobiologii z parazytologią: wykłady, seminaria, ćwiczenia
Termin zajęć: semestr zimowy i semestr letni
WYKŁADY
Prowadzący: prof. Małgorzata Bulanda, dr hab. Barbara Zawilińska, dr Paweł Krzyściak, dr Agata Pietrzyk
Liczba godzin:
Miejsce: Centrum Dydaktyczno-Kongresowe Wydziału Lekarskiego, ul. św. Łazarza 16
Tematy:
Wykład 1B
Podstawy mikrobiologii. Morfologia, fizjologia i sposoby klasyfikacji bakterii. Budowa komórki bakteryjnej. Genom bakteryjny. Genetyczne podłoże zmienności u bakterii. Epidemiologia zakażeń bakteryjnych.
Wykład 2W
Właściwości biologiczne i budowa wirusów. Podstawy klasyfikacji. Etapy replikacji wirusów. Patogeneza zakażeń wirusowych, działanie onkogenne i teratogenne wirusów. Epidemiologia i zasady profilaktyki zakażeń wirusowych.
Wykład 3M
Wprowadzenie do mykologii medycznej. Epidemiologia i profilaktyka grzybic. Grzyby jako alergeny. Mykotoksyny i mykotoksykozy.
Wykład 4P
Definicja pasożytnictwa. Układ pasożyt-żywiciel oraz mechanizmy chorobotwórczego oddziaływania pasożytów na organizm człowieka. Epidemiologia i profilaktyka zarażeń pasożytniczych.
Wykład 5B
Zakażenia szpitalne. Epidemiologia i etiologia
SEMINARIA
Prowadzący: prof. Małgorzata Bulanda, dr hab. Monika Brzychczy-Włoch, dr hab. Agnieszka Chmielarczyk, dr hab. Tomasz Gosiewski, dr hab. Anna Różańska, dr hab. Sława Szostek, dr hab. Barbara Zawilińska, dr Małgorzata Biernat-Sudolska, dr Artur Drzewiecki, dr Paweł Krzyściak, dr Agata Pietrzyk, dr Magdalena Skóra, dr Katarzyna Talaga- Ćwiertnia
Liczba godzin:
Miejsce: Katedra Mikrobiologii UJ CM, ul. Czysta 18, sale dydaktyczne II piętro
Tematy:
Seminarium 1B
Flora fizjologiczna i mechanizmy tworzenia się mikrobiomu człowieka. Patogeneza zakażeń bakteryjnych i czynniki chorobotwórczości bakterii. Bakteryjne czynniki etiologiczne zakażeń u ludzi – ziarenkowce Gram-dodatnie.
Seminarium 2B
Epidemiologia, patogeneza i czynniki chorobotwórczości bakterii Gram-ujemnych (pałeczki Gram-ujemne, ziarenkowce Gram-ujemne). Szczepionki profilaktyczne.
Seminarium 3B
Epidemiologia, patogeneza, czynniki chorobotwórczości pozostałych bakterii Gram-dodatnich (laseczki Gram-dodatnie sporulujące i niesporulujące, bakterie beztlenowe Gram-dodatnie) i Gram ujemnych (beztlenowe bakterie Gram-ujemne). Szczepionki profilaktyczne.
Seminarium 4B
Chorobotwórczość prątków oraz epidemiologia i profilaktyka zakażeń. Oporność bakterii na antybiotyki i chemioterapeutyki.
Seminarium 5B
Epidemiologia i chorobotwórczość krętków, promieniowców, mykoplazm, chlamydii i riketsji. Profilaktyka zakażeń.
Seminarium 6B
Sterylizacja, dezynfekcja i aseptyka: zasady i metody dezynfekcji i sterylizacji, mechanizm działania środków dezynfekcyjnych, metody kontroli procesu sterylizacji, zasady prawidłowej antyseptyki.
Seminarium 7W
Wybrane wirusy RNA, ich cechy biologiczne i chorobotwórcze, epidemiologia i możliwości profilaktyki (ortomyksowirusy, paramyksowirusy, koronawirusy, pikornawirusy, astrowirusy, reowirusy, togawirusy, rabdowirusy).
Seminarium 8W
Cechy biologiczne i chorobotwórcze wybranych wirusów DNA (herpeswirusy, adenowirusy, papillomawirusy, parwowirusy, pokswirusy).
Seminarium 9W
Cechy biologiczne i chorobotwórcze wirusów wywołujących zapalenia wątroby (HBV, HDV, HCV, HGV, HAV, HEV), epidemiologia tych zakażeń i możliwości profilaktyki.
Seminarium 10W
Retrowirusy zakażające ludzi i przebieg zakażenia HIV. Możliwości chemioterapii w zakażeniach wirusowych i problem lekooporności. Priony.
Seminarium 11M
Najczęstsze czynniki etiologiczne grzybic człowieka.
Seminarium 12M
Patogeneza zakażeń grzybiczych.
Seminarium 13P
Cykle życiowe i inwazyjne dla człowieka stadia rozwojowe wybranych pierwotniaków (G.intestinalis, E. histolytica i inne pełzaki, Cryptosporidium, Balantidium coli, T. vaginalis, T. gondii) oraz podstawowe objawy chorobowe towarzyszące zarażeniom.
Seminarium 14P
Cykle życiowe i inwazyjne dla człowieka stadia rozwojowe wybranych robaków (Fasciola, Taenia, Diphylobothrium, Echinococcus, Enterobius, Ascaris, Trichuris, , Trichinella, Toxocara, węgorek, tęgoryjce) oraz podstawowe objawy chorobowe towarzyszące zarażeniom.
Seminarium 15P
Cykle życiowe i inwazyjne dla człowieka stadia rozwojowe wybranych pasożytów tropikalnych i ektopasożytów oraz podstawowe objawy chorobowe towarzyszące zarażeniom.
ĆWICZENIA
Prowadzący: dr hab. Monika Brzychczy-Włoch, dr hab. Agnieszka Chmielarczyk, dr hab. Anna Różańska, dr hab. Sława Szostek, dr hab. Jadwiga Wójkowska-Mach, dr hab. Barbara Zawilińska, dr Małgorzata Biernat-Sudolska, dr Artur Drzewiecki, dr Piotr Kochan, dr Paweł Krzyściak, dr Agata Pietrzyk, dr Dominika Salamon, dr Magdalena Skóra, dr Katarzyna Talaga- Ćwiertnia, dr Anna Tomusiak-Plebanek, mgr Agnieszka Gibała, mgr Agnieszka Krawczyk
Liczba godzin:
Miejsce: Katedra Mikrobiologii UJ CM, ul. Czysta 18, sala ćwiczeń II piętro
Tematy:
Ćwiczenia 1B
Zasady pobierania i przesyłania materiałów do badań bakteriologicznych. Metody hodowli bakterii na sztucznych podłożach wzrostowych w warunkach tlenowych i beztlenowych.
Ćwiczenia 2B
Barwienie metodą Grama. Inne metody barwienia. Preparaty bezpośrednie. Interpretacja wyników.
Ćwiczenia 3B
Izolacja i identyfikacja bakterii. Wybrane testy identyfikacji paciorkowców, gronkowców i pałeczek Gram-ujemnych.
Ćwiczenia 4B
Badanie bakteriologiczne jakościowe i ilościowe – na przykładzie diagnostyki moczu. Interpretacja wyników. Metody oznaczania lekooporności bakterii i interpretacja wyników tych oznaczeń.
Ćwiczenia 5B
Diagnostyka gruźlicy, kiły, zakażeń chlamydiowych i mykoplazmowych. Interpretacja wyników badań prowadzonych metodami klasycznymi, serologicznymi i molekularnymi.
Ćwiczenia 6B
Higiena rąk. Metody genetyczne w identyfikacji szczepów klinicznych. Interpretacja wyników.
Ćwiczenia 7W
Zasady diagnostyki wirusologicznej. Pobieranie i przesyłanie materiału klinicznego. Metody namnażania i mianowania wirusów.
Ćwiczenia 8W
Metody serologiczne stosowane w identyfikacji wirusów (odczyn neutralizacji, IF, PAP, APAP, aglutynacja lateksowa, immunochromatografia). Diagnostyka serologiczna wirusów oddechowych, grypy i różyczki (OZHA, OWD, ELISA). Interpretacja wyników oznaczeń serologicznych.
Ćwiczenia 9W
Molekularne metody w diagnostyce CMV, EBV, HSV, HPV. Diagnostyka wirusowego zapalenia wątroby typu B i C – markery serologiczne w ostrym i przewlekłym zapaleniu wątroby.
Ćwiczenia 10W
Diagnostyka zakażeń HIV, oznaczanie markerów prognostycznych i interpretacja wyników (ELISA, western-blot, RT-PCR, PCR czasie rzeczywistym).
Ćwiczenia 11M
Podstawy medycznej diagnostyki mykologicznej cz. I.
Ćwiczenia 12M
Podstawy medycznej diagnostyki mykologicznej cz. II.
Ćwiczenia 13P
Materiały i metody stosowane w diagnostyce zarażeń pierwotniakami. (mikroskopia i koproskopia, hodowla, serologia). Ważne diagnostycznie cechy pierwotniaków. Interpretacja wyników badań.
Ćwiczenia 14P
Materiały i metody stosowane w diagnostyce robaczyc (metody makroskopowe i mikroskopowe, serologia). Ważne diagnostycznie cechy robaków. Interpretacja wyników badań.
Ćwiczenia 15P
Materiały i metody stosowane w diagnostyce zarażeń Plasmodium (malaria), Leishmania, Trypanosoma: mikroskopia (rozmazy krwi), immunodiagnostyka, metody molekularne oraz zarażeń ektopasożytami. Interpretacja wyników.
TERMINY ZAJĘĆ
Szczegóły w zakładce Harmonogramy
OBOWIĄZUJĄCY STRÓJ
Na zajęciach obowiązuje strój zgodny z “dress code” dla studentów Wydziału Lekarskiego UJ CM.
DODATKOWE WYMAGANIA W ZAKRESIE UBIORU
Ze względu na charakter zajęć (kontakt z materiałem zakaźnym) student przed przystąpieniem do ćwiczeń ma obowiązek założyć fartuch ochronny. Fartuchy ochronne są dostarczone przez Katedrę Mikrobiologii i dostępne przed wejściem na salę ćwiczeń.
MIEJSCE PRZEBIERANIA SIĘ STUDENTÓW
Ze względu na brak szatni ogólnej w budynku, studenci są zobowiązani do pozostawienia wierzchniej odzieży oraz rzeczy osobistych w zamykanych szafkach indywidualnych mieszczących się na II piętrze, w korytarzu przy sali ćwiczeń.
Szafki ubraniowe są zamykane na zamki kłódkowe. Każdy student jest zobowiązany do zaopatrzenia się w osobistą kłódkę, która posiada średnicę pałąka 6 mm lub 7 mm.
REGULAMIN ZAJĘĆ
Przedmiot: Mikrobiologia z parazytologią
- Przedmiot Mikrobiologia z parazytologią jest realizowany na II roku kierunku lekarskiego i wraz z przedmiotem Immunologia tworzy moduł kończący się wspólnym egzaminem
- Student rozpoczyna i kończy zajęcia z grupą dziekanatową, do której został wpisany.
- W czasie zajęć praktycznych z Mikrobiologii z parazytologią odbywających się na sali ćwiczeń student jest narażony na kontakt z materiałem zakaźnym. Ze względu na to należy ściśle i bezwzględnie przestrzegać zaleceń asystentów prowadzących zajęcia.
- Zaliczenie modułu wymaga spełnienia następujących warunków:
- obecności na zajęciach (na zajęciach z Mikrobiologii z parazytologią dopuszczalne są maksymalnie 2 usprawiedliwione nieobecności)
- aktywności na zajęciach i wykonania określonego zadania (ćwiczenia) wskazanego przez prowadzącego zajęcia.
- zaliczenia co najmniej dwóch z trzech sprawdzianów z Mikrobiologii z parazytologią przeprowadzanych w ciągu semestru.
- Spełnienie powyższych kryteriów stanowi podstawę dopuszczeniu studenta do egzaminu końcowego w zakresie Mikrobiologii z parazytologią.
- Egzamin końcowy obejmuje materiał realizowany na seminariach i ćwiczeniach.
- Student otrzymuje końcową ocenę łączną z Mikrobiologii z parazytologią i Immunologii.
- Warunkiem zdania końcowego egzaminu z Mikrobiologii z parazytologią jest uzyskanie co najmniej 60% prawidłowych odpowiedzi (zaliczenie całego modułu wymaga równoczesnego uzyskania co najmniej 60% poprawnych odpowiedzi z Immunologii).
- Uzyskanie mniej niż 60 % poprawnych odpowiedzi w zakresie Mikrobiologii z parazytologią (lub Immunologii) w pierwszym lub w drugim terminie skutkuje brakiem zdania egzaminu końcowego i zaliczenia modułu.
- I i II termin egzaminu końcowego określa harmonogram zajęć. Brak przystąpienia przez studenta do egzaminu w wyznaczonym terminie, nie poparty usprawiedliwieniem nieobecności skutkuje brakiem zaliczenia modułu.
- Do oceny końcowej dolicza się po 3 punkty za każdy sprawdzian śródsemestralny z Mikrobiologii z parazytologią, na którym student osiągnął wynik bardzo dobry i po 1 punkcie w przypadku otrzymania wyniku plus dobry. Maksymalnie możliwe jest doliczenie 9 punktów z Mikrobiologii z parazytologią (w ramach całego modułu maksymalnie 15 punktów).
- Dodatkowe punkty są doliczane do punktacji końcowej jedynie w przypadku uzyskania przez studenta co najmniej 60% poprawnych odpowiedzi na teście końcowym (kryterium to dotyczy zarówno Mikrobiologii z parazytologią, jak i Immunologii).
